Немного уменьшилось число сбойных секторов, уже что-то. Попробуйте сделать вот что: ЖД у вас с интерфейсом IDE, попробуйте заменить сигнальный шлейф на новый и снова провести проверку.
И еще: проверьте рукой температуру радиаторов на плате, кроме процессорного, при работе. Возможен перегрев южного моста, оттого и долго ЖД думает.
Проверил рукой температуру северного моста - горячий, долго держать руку нельзя, температуру южного моста проверил внутреней стороной руки - рука может некоторое (немалое) время там находиться, но когда попробовал внешней частью пальцев - ощутил, что северный мост также в некоторой степени горячий, дольше 6 с. держать нельзя - чувствуешь дискомфорт.
Шлейфы тоже теряют свои рабочие качества в процессе эксплуатации? Что же, попробую заменить шлейф на новый и сообщу результат. У меня винчестер находится на одном шлейфе с дисководом, он работает в режиме "Master", а дисковод "Slave", так как на материнке имеется в наличии только 1 ide-слот (или контролер).